Na pierwszym zebraniu organizacyjnym, które odbyło się w lipcu 1957 r., została wybrana pierwsza sześcioosobowa  Rada Nadzorcza i trzyosobowy Zarząd Spółdzielni, która otrzymała nazwę MSM „Projektant”. Został przyjęty statut i uchwalony program działania na najbliższe lata.

W 1958 r. Spółdzielnia została wpisana do rejestru sądowego i w tym samym roku na pierwszym Walnym Zebraniu Członków ustalono program inwestycyjny na lata 1958-1961.

W 1959 r. Walne Zebranie zmieniło profil działania Spółdzielni na resortową obejmującą pracowników branży budowlanej, przez co została zmieniona nazwa na MSM „Budowlani”.

W roku 1967 nastąpiła ostateczna zmiana nazwy na Spółdzielnię Mieszkaniową „Mokotów”, która funkcjonuje do dzisiaj.

Od początku istnienia Spółdzielnia związana była z rozwojem Mokotowa – największej dzielnicy Warszawy.

Przez wszystkie lata istnienia SM „Mokotów” oddała do użytku wiele budynków mieszkalnych oraz przyjęła do swoich zasobów budynki innych Spółdzielni. Posiadała wiele administracji, które z czasem zaczęły wydzielać się w odrębne spółdzielnie.