w ramach realizowanego projektu pt. „Toward tumor-agnostic multiomic biomarkers in early detection of non-small lung cancer relapse”. Projekt finansowany przez Agencję Badań Medycznych w ramach programu TRANSMED I .
Miejsce pracy: Gdańsk
wymiar czasu pracy: 2 x 1 etat
zatrudnienie w oparciu o umowę o pracę
DO ZADAŃ OSOBY ZATRUDNIONEJ NA TYM STANOWISKU BĘDZIE NALEŻAŁO:
- analiza danych z sekwencjonowania Oxford Nanopore, w tym wzorców metylacji DNA oraz rozkładów długości fragmentów,
- opracowanie modeli predykcyjnych z wykorzystaniem metod uczenia maszynowego do wykrywania ctDNA pochodzenia nowotworowego na podstawie cech epigenomicznych i fragmentomicznych,
- projektowanie i implementacja algorytmów klasyfikacyjnych opartych na aktywności regionów regulatorowych i pozycjonowaniu nukleosomów,
- przygotowanie czystego, udokumentowanego i możliwego do odtworzenia kodu,
- wstępna analiza i interpretacja danych uzyskanych w wyniku sekwencjonowania,
- ścisła współpraca z zespołami klinicznymi i biologii molekularnej w zakresie interpretacji danych i walidacji klinicznej,
- prowadzenie dokumentacji badawczej oraz przygotowywanie materiałów do publikacji naukowych i wniosków patentowych,
- prezentowanie wyników badań podczas spotkań zespołu projektowego, seminariów naukowych, konferencji krajowych i międzynarodowych oraz innych wydarzeń naukowych.
OD KANDYDATÓW OCZEKUJEMY:
- licencjat/stopień inżyniera lub magisterium z bioinformatyki, matematyki, biologii, biotechnologii lub kierunków pokrewnych,
- doświadczenie w pracy z językami Python i R oraz zastosowaniach uczenia maszynowego,
- mile widziane doświadczenie w analizie danych obrazowych oraz ich integracji z danymi molekularnymi,
- znajomość analizy bioinformatycznej danych typu genome-wide będzie dodatkowym atutem,
- umiejętność planowania, przeprowadzania i dokumentowania eksperymentów naukowych,
- biegła znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie.
OFERUJEMY:
- umowę o pracę na czas określony na pełen etat,
- ilość etatów: 2
- pracę w najlepszej uczelni medycznej w Polsce, posiadającej status uczelni badawczej,
- możliwość podnoszenia kompetencji w ramach obejmowanego stanowiska,
- atrakcyjny pakiet świadczeń pozapłacowych.
Poznaj
GDAŃSKI UNIWERSYTET MEDYCZNY
Gdański Uniwersytet Medyczny to nie tylko najlepsza uczelnia medyczna w Polsce, która plasuje się w pierwszej dziesiątce najlepszych polskich uczelni państwowych (6 miejsce).
Gdański Uniwersytet Medyczny to złożona organizacja, o długiej tradycji, wielu osiągnięciach i ogromnych możliwościach.
Obok wypełniania zadań dydaktycznych i badawczych, pełni również rolę organu założycielskiego dla czterech podmiotów leczniczych. Publikacje naukowców GUMed są jednymi z najczęściej cytowanych w prestiżowych czasopismach (wysoki Impact Factor).
Gdański Uniwersytet Medyczny to ośrodek akademicki, który stawia na praktyczne nauczanie zawodu w oparciu o nowoczesną infrastrukturę dydaktyczną – posiadamy m.in. nowoczesne pracownie multimedialne wykorzystujące druk 3D i zakłady symulacji.
W ciągu 75 lat bogatej historii pracownicy Uczelni i Szpitali wspólnie przyczynili się do utworzenia unikatowych jednostek w skali kraju m.in. Centrum Udarowego czy Centrum Medycyny Translacyjnej.
Gdański Uniwersytet Medyczny jest miejscem styku wielu kultur dzięki realizowanym studiom anglojęzycznym (English Division) i nawiązywanej współpracy z zagranicznymi partnerami, w tym uczelniami.
Gdański Uniwersytet Medyczny jest organizacją, która odważnie patrzy w przyszłość i stawia sobie wiele ambitnych celów. Uczelnia podejmuje wysiłek, by wzmocnić synergię dydaktyki, nauki oraz profesjonalnego zarządzania.
