Ogłoszenie numer: 7550022, z dnia 2022-09-27
Instytut Hematologii i Transfuzjologii i Instytut Biochemii i Biofizyki PAN
poszukują kandydata na stanowisko post-doc na okres 24 miesięcy przy realizacji grantu naukowego OPUS pt.: „Inhibicja szlaku MIA (mitochondrial intermembrane space assembly) jako nowa metoda na zapobieganie metabolicznemu przeprogramowaniu opornych na terapię białaczkowych komórek macierzystych” finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki
Post-doc
Miejsce pracy: Warszawa
Nr Ref.: NCN nabór OPUS – ND
Opis stanowiska
Opis projektu
AML jest najczęściej występującą postacią ostrej białaczki u osób dorosłych: odpowiada za 62% wszystkich zgonów spowodowanych białaczką i zajmuje najgorsze miejsce pod względem pięcioletniego przeżycia według typu nowotworu, po nowotworach trzustki, płuc, wątroby i przełyku. Uznaje się, że istnieje populacja białaczkowych komórek macierzystych (LSC), które są bardziej odporne na chemioterapię i mogą prowadzić do nawrotu choroby.
APE1 jest niezbędnym enzymem w szlaku naprawy DNA przez wycinanie zasad (BER), który jest odpowiedzialny za naprawę zarówno jądrowych, jak i mitochondrialnych uszkodzeń oksydacyjnych DNA. APE1 jest importowany do mitochondriów w warunkach stresu oksydacyjnego, a szlakiem odpowiedzialnym za wejście APE1 do mitochondrialnej przestrzeni międzybłonowej (IMS) jest szlak MIA (Mitochondrial Intermembrane Space Assembly. Mia40 i ALR reprezentują centralne elementy szlaku MIA, które wykorzystują system redoks do kierowania białek bogatych w cysteinę do przedziału mitochondrialnego.
W ramach projektu planowane jest opracowanie innowacyjnej strategii selektywnego niszczenia LSC opornych na terapię poprzez hamowanie szlaku MIA. Aby osiągnąć ten cel, zamierzamy zastosować dwie równoległe strategie hamowania szlaku MIA: podejście oparte na peptydach hamujących Mia40 oraz podejście do badań przesiewowych leków in silico w celu opracowania modulatorów małocząsteczkowych.
Projekt ten poszerzy naszą wiedzę na temat roli szlaku MIA w zachowaniu komórek nowotworowych oraz jego roli w metabolicznym przeprogramowaniu komórek AML opornych na terapię, kładąc podwaliny pod rozwój alternatywnych lub pomocniczych sposobów leczenia tego agresywnego nowotworu
Zakres zadań:
Wybrany kandydat będzie zajmował się wszystkimi zadaniami przesiewowymi i modelowania molekularnego oraz udziałem w planowaniu/prowadzeniu bezpośrednich testów eksperymentalnych. Szczególny nacisk zostanie położony na umiejętności modelowania molekularnego danych, techniki przygotowania i prowadzenia obróbki danych metodami wrangling (pozyskiwanie i filtrowanie danych). Kandydat posługuje się technikami obliczeniowymi, takimi jak dokowanie molekularne, mechanika molekularna i symulacje dynamiki. Na koniec będzie tworzyć i testować modele ML/DL.
Wymagania
Wcześniejsze doświadczenie zdobyte podczas studiów doktoranckich i/lub post-doc w zakresie bioinformatyki i badań strukturalnych.
Dodatkowe wymagane umiejętności:
- Umiejętność programowania (Python i/lub R)
- Znajomość podstaw chemii i/lub chemii obliczeniowej.
- Umiejętności cheminformatyczne (rdkit, openbabel, knime, itp.) będą dodatkowym atutem.
- Dodatkowym atutem będzie podstawowa znajomość frameworków ML/DL (Tensorflow i/lub PyTorch).
Przewidywana średnia wysokość stypendium: 10 000 zł/miesiąc (brutto/brutto) przez okres 18 miesięcy z możliwością przedłużenia.
Poznaj
Instytut Hematologii i Transfuzjologii
Instytut Hematologii i Transfuzjologii jest głównym w Polsce ośrodkiem naukowym w zakresie hematologii i transfuzjologii oraz referencyjnym ośrodkiem kliniczno-diagnostycznym.Misją Instytutu Hematologii i Transfuzjologii jest udzielanie wysokospecjalizowanych świadczeń zdrowotnych oraz prowadzenie badań naukowych i prac rozwojowych dla postępu nauki w zakresie hematologii, transfuzjologii i dyscyplin pokrewnych przy zachowaniu dbałości o przyjazne i bezpieczne warunki pobytu pacjentów i pracy personelu Instytutu.Instytut prowadzi działalność leczniczą (lekarze, pielęgniarki), diagnostyczną (diagności), naukową i dydaktyczną. Dodatkowo pracownicy biurowi dbają o obsługę lecznictwa, finanse, obsługę kadrowo-płacową, właściwy sprzęt badawczo-diagnostyczny oraz zaawansowane systemy IT wspierające codzienną pracę.Jeżeli w ogłoszeniach zarówno na naszej stronie internetowej jak i praca.pl nie ma ogłoszenia o rekrutacji na stanowisko na jakie jesteście Państwo zainteresowani aplikacje można wysłać na rekrutacja@ihit.waw.pl Zostanie ona przekierowana do ewentualnie zainteresowanego działu.Działalność lecznicza Instytutu obejmuje:-diagnostykę i leczenie chorób układu krwiotwórczego i chłonnego-diagnostykę i leczenie zaburzeń hemostazy-opiekę nad chorymi na porfirię-przeszczepianie krwiotwórczych komórek macierzystych-leczenie chirurgiczne, w tym również u chorych z wrodzonymi i nabytymi zaburzeniami krzepnięcia krwi oraz w zakresie chirurgii naczyń.
Działalność lecznicza realizowana jest w pięciu klinikach:1/ Klinika Hematologii,2/ Klinika Zaburzeń Hemostazy i Chorób Wewnętrznych,3/ Klinika Transplantacji Komórek Krwiotwórczych,4/ Klinika Chirurgii Ogólnej, Onkologicznej i Hematologicznej,5/ Klinika Chirurgii Naczyniowej,oraz na Oddziale Anestezjologii i Intensywnej Terapii, Oddziale Leczenia Dziennego, Oddziale Badań Klinicznych oraz na Bloku Operacyjnym..Działalność diagnostyczna Instytutu obejmuje szeroki zakres badań laboratoryjnych niezbędnych w diagnostyce chorób układu krwiotwórczego i chłonnego, układu hemostazy, chorób metabolicznych oraz badania z zakresu immunologii transfuzjologicznej, diagnostyki allo- i autoimmunizacji antygenami komórek krwi, diagnostyki konfliktu matczyno-płodowego, powikłań potransfuzyjnych, wrodzonych i nabytych anemii hemolitycznych i badań chimeryzmu. W Instytucie prowadone są również badania wirusologiczne w zakresie diagnostyki i epidemiologii wirusów ważnych ze względu bezpieczeństwa przetoczeń krwi oraz immunogenetyczne typowanie biorców i dawców do przeszczepienia krwiotwórczych komórek macierzystych. Instytut wykonuje badania obrazowe, diagnostykę chorób naczyń i badania endoskopowe w szerokim zakresie.
